احد الأسباب الطبيعية الأكثر شيوعاً في كون الطفل قصير القامة هو وجود قصر قامة وراثي عند الوالدين ووجود أفراد آخرون في الأسرة قصار القامة. ينمو مثل هؤلاء الأطفال عادة بمعدلات نمو طبيعية رغم كونهم قصار القامة وقد يتبعون منحنى نمو يمكن أن يكون " أدنى " ولكن يمشي بالتوازي مع منحنيات النمو الطبيعية، وبالرغم من أن الاختبار بشكل روتيني ليس ضرورياً فان إجراء اختبار " العمر العظمي " سيكون طبيعياً وغير متأخر.
سبب آخر شائع لقصر القامة في الأطفال هو " تأخر النمو البنيوي " أو الجسمي والأطفال الذين لديهم هذا التغير الطبيعي في معدل النمو يكونوا قصار القامة وبمعدل نمو يساوي أو أدنى من المنحنى الثالث ولكن سرعة أو معدل نموهم يكون عادياً / 2 ـ 2.5 / إنش في السنة وسوف يكون لهؤلاء الأطفال " عمر عظمي " متأخر كما أنه غالباً ما يكون لديهم تأخر في " بدء سن البلوغ " ، وبرغم كونهم قصار القامة فان الأطفال الذين لديهم تأخر نمو بنيوي سوف يستمرون بالنمو بشكل عادي ، بينما يكون قد توقف نمو اقرانهم الآخرين ، وسوف يصلون إلى طول سن الرشد النهائي والذي سيكون قريباً من الطولالمتوقع.
اضافة للتغير على منحنى النموهنالك إشارات اخرى يمكن أن تدل على وجود مشكلة طبية مسببة لقصر القامة مثل وجود حالة طبية مزمنة ( سوء امتصاص ، فشل كلوي ..) أو أعراض مثل الاقياء المستمر ، الإسهال ، الحمى ، نقصان الوزن ، فقدان الشهية ، سوء التغذية ، آلام الرأس ، تأخر البلوغ ، قصر قامة غير متناسق (يمكن أن يكون دلالة لاضطراب صبغي) ، أو قصر قامة مع زيادة في الوزن (مشكلة هرمونية أو في الغدد الصماء).
