يتم علاج قرحة المعدة بعدة طرق منها:
العقاقير الدوائية المثبطة لانتاج أحماض المعدة.
المُضادات الحيوية للتخلص من البكتيريا الملوية البابية .
التوقف عن استخدام مضادات الالتهاب الغير ستيرويدية .
التدخل الجراحي في حال حدوث أي من المضاعفات المرافقة للقرحة كالنزيف أو انثقاب المعدة .