أسباب تشكل حصى الكلى هي: الإصابة بمرض النقرس والذي يسببه تراكم حمض اليوريك في المفاصل. ارتفاع نسبة الكالسيوم في البول. ارتفاع نسبة حمض اليوريك في البول. مرض الأمعاء الدقيقة. أمراض التهاب الأمعاء والتي تشمل مرض الكرونز والتهاب القولون التقرحي. مرض البيلة السيستينية. تشوهات الكلى. بعض العمليات الجراحية. التهاب المسالك البولية.
