تقوم بعض أدوية مرض كرون بحجب وظيفة جهاز المناعة، والمرتبطة بخطر الإصابة بالسرطان نسبة صغيرة، ومن هذه السرطانات سرطان الغدد الليمفاوية، وسرطان الجلد، كما أن هذه الأدوية قد تزيد من خطر الإصابة بالعدوى. ويمكن أن يتسبب الكورتيكوسترويد بخطر الإصابة بترقق العظام، وكسور العظام، والمياه البيضاء، والمياه الزرقاء، والسكري، وارتفاع ضغط الدم، وغيرها، والعمل مع الطبيب يساعد في تحديد مخاطر وفوائد الأدوية.