الجلطات التي تتكون بالمخ قد تكون ناتجة عن بقايا الدهون الموجودة بجدران الأوعية الدموية التي تنقل الدم إلى المخ. أو في بعض الحالات قد تتكون هذه الجلطات بسبب صدمة تعرض لها المخ أو إصابة تسببت في ارتجاج المخ. في حالات أخرى قد تبدأ الجلطة في التكوّن في مكان آخر من الجسم، مثل الصدر أو الرقبة، ثم تدخل مسار الدم وتنتقل إلى المخ، مما يتسبب في سكتة دماغية.