يعتمد علاج الحمى الشوكية على النوع، ولذلك يكون العلاج كالتالي: حيث يتم علاج الحمى الشوكية الفيروسية عن طريق الراحة والمسكنات وشرب السوائل، وتختفي من تلقاء نفسها خلال حوالي أسبوع إلى 10 أيام أو بضع أسابيع، لكن بعض الحالات قد يختلف فيها الأمر وتحتاج علاج آخر مثل الأدوية للتحكم في النوبات أو الكورتيكوستيرويدات من أجل خفض التورم في الدماغ، أو الأدوية المضادة للفيروسات. أما علاج الحمى الشوكية البكتيرية وهي أشد خطورة لذلك ستحتاج علاج خاص من خلال المضادات الحيوية وأحيانا قد يتم استخدام الستيرويدات القشرية، وذلك لتفادي خطر حدوث بعض المضاعفات مثل تورم الدماغ. وفي حال كان السبب غير معروف في البداية، قد يلجأ الطبيب إلى مضادات الفيروسات أو المضادات الحيوية حتى يتم التشخيص الصحيح، وإن كانت من نوع الالتهاب المزمن، فسيعمل الطبيب على تحديد السبب وراء الإصابة به، حتى يقوم بعلاجه بشكل صحيح. أما بالنسبة للحمى الشوكية الطفيلية فلا يوجد علاج محدد لها، بل يمكن أن يتم اللجوء إلى مسكنات الصداع والألم، إلى جانب أدوية تقلل من رد فعل الجسم تجاه الطفيلي، أما الحمى الشوكية الفطرية فيتم علاجها بمضادات الفطريات، أما الأنواع غير المعدية مثل تلك الناتجة عن مرض مناعي أو نتيجة حساسية، سيتم علاجها من خلال الكورتيكوستيرويدات، أما إن كانت الحمى الشوكية مرتبطة بالسرطان فسيكون المطلوب هنا علاج مرض السرطان.
