الجراثيم هي التي تسبب التهاب اللوز الفيروسي والبكتيري المعدي، لذلك فإن أفضل طرق الوقاية هي ممارسة النظافة الجيدة، مثل: غسل اليدين جيدًا وبشكل متكرر، خاصةً بعد استخدام المرحاض وقبل الأكل تجنب مشاركة الطعام أو شرب الكؤوس أو زجاجات الماء أو الأواني استبدل فرشاة الأسنان بعد تشخيص التهاب اللوزتين.
