غالبًا ما يكون سبب التهاب اللوز هو فيروسات شائعة، لكن العدوى البكتيرية قد تكون هي السبب أيضًا. وأكثر أنواع البكتيريا شيوعًا التي تسبب التهاب اللوز هي العقدية المقيحة (المجموعة أ العقدية)، وهي البكتيريا التي تسبب التهاب الحلق، سلالات أخرى من بكتيريا وغيرها من البكتيريا قد تسبب أيضاً التهاب اللوزتين.