قد يعاني بعض الأطفال من اعراض جرثومة المعدة والتي قد تضمن ألم في البطن، الغثيان والقيء، كما قد يصاب الأطفال الأكبر سنا بحدوث قرح هضمية والتي يزداد الشعور بآلامها عندما تكون المعدة فارغة، وتبدأ الاعراض في التحسن مع شرب الحليب أو تناول الأطعمة أو الادوية المضادة للحموضة. و قد يعاني الأطفال من قرح دموية، مما قد يتسبب في حدوث قيء دموي أو براز اسود أو دموي. الا انه قد لا تكون تلك الاعراض واضحة على الأطفال الأصغر سنا، مما يجعل تشخيص مرضهم أكثر صعوبة.
