يتوافر عدد محدود من الدراسات حول مدى علاقة جرثومة المعدة بارتجاع المريء، الا انه قد توصلت احد الدراسات، والتي أجريت في مستشفى ساكاريا نيوسيتي عام 2006 إلى ظهور عدوى جرثومة المعدة لدى كثير من المرضى الذين يعانون من ارتجاع المريء. كما وجد انها عامل مسبب لتطور القرح الهضمية. وعلى الرغم من إشارة بعض الأدلة للدور المحتمل لعدوى جرثومة المعدة في زيادة تفاقم اعراض ارتجاع المريء، الا انه لا يزال الجدل قائم حتى الأن حول مدى العلاقة بين الإصابة بجرثومة المعدة وارتجاع المريء.