من اجل علاج جرثومة المعدة، فأنه يتم أولا التشخيص، وطلب التحاليل للكشف عن وجود البكتيريا. وذلك عن طريق التالي: تحليل الدم، تحليل البراز، تحليل التنفس. وفي حالة التأكد من وجود العدوى، فإن الأطباء عادة يعالجون المريض باستخدام مجموعة من المضادات الحيوية.