يعتمد علاج صديد البول على السبب الكامن وراءها؛ عادةً ما تسبب التهابات المسالك البولية حدوث صديد البول ويتضمن العلاج دورة قصيرة من العلاج بالمضادات الحيوية، مثل تريميثوبريم – سلفاميثوكسازول عن طريق الفم أو نتروفورانتوين. ويمكن للمضادات الحيوية أيضاً علاج الأمراض البكتيرية المنقولة جنسياً والسل؛ إذا لم يحدث تحسن بعد تناول المضادات الحيوية بشكل كامل، فقد تكون هناك حالة مرضية أكثر خطورة. وفي بعض الحالات قد يؤدي إيقاف الأدوية التي تؤدي إلى زيادة خلايا الدم البيضاء إلى علاج صديد البول، ومع ذلك من الضروري استشارة الطبيب قبل إيقاف أو تغيير أي أدوية.