كخط أول من علاج التهاب المسالك البولية، من المرجح أن يصف الطبيب المضادات الحيوية. إذا كانت كليتك مصابة (التهاب الحويضة والكلية)، فقد يصف الطبيب دواء الفلوروكينولون،
أما إذا كنت تعاني من التهاب المسالك البولية الحاد، فقد يوصي الطبيب بالدخول إلى المستشفى وأخذ المضادات الحيوية عن طريق الوريد
