يُجرى تشخيص الفطر الأسود عن طريق الخطوات الآتية: التعرف على التاريخ المرضي للمريض. التعرف على كل الأعراض التي يعاني منها. الفحص البدني. إجراء بعض التحاليل اللازمة. أخذ خزعة لفحصها في المختبر باستخدام المجهر، أو التعرف عليها من خلال مزرعة الفطريات fungal culture. الخضوع للأشعة المقطعية.
