جرثومة المعدة هي نوع من البكتيريا يعرف بـ Helicobacter pylori ويتعايش في المعدة وفي الإثنى عشر، وتسبب الالتهابات للشخص المصاب بها، كما أنها تسبب بعض الأمراض مثل قرحة المعدة، ويمكن مع عدم علاجها بسرعة أن تتطور إلى سرطان المعدة، وتزيد هذه البكتيريا من حموضة المعدة بسبب وجودها في السائل الحمضي للمعدة.